En la Administración de los Recursos de SI, la organización de los Sistemas de Información se refiere a la estructura interna de los SI.
Existen varias estructuras o enfoques que evolucionaron a lo largo del tiempo, y todos pueden coexistir dentro de una empresa. Todos tienen ciertas ventajas y desventajas. La elección adecuada debe hacerse teniendo en cuenta la Estrategia de SI.
Estos enfoques o estructuras son:
- Enfoque tradicional.
- Estructura de bases de datos.
- Grupos de proyectos funcionales.
- Centro de información y apoyo de decisiones.
- Estructuras externas.
Enfoque Tradicional
Esta estructura es el departamento de procesamiento de datos con áreas separadas de desarrollo, mantenimiento y operación. Soporta un alto grado de especialización. Como cada proyecto debe moverse entre diferentes equipos, requiere estandarización burocracia.
Desventajas:
- Retraso: los desarrollos y mantenimientos demoran los usuarios están descontentos.
- Sistemas proscritos: énfasis en aspectos técnicos por sobre el uso.
- Sistemas inflexibles: demasiadas especificaciones formales.
- Mantenimiento costoso: suele presentarse un escaso uso de herramientas de productividad.

Estructura de Bases de Datos
Se organiza en base a las necesidades de almacenamiento de datos. Los datos se separan de las aplicaciones y se reagrupan para el análisis, diseño y desarrollo. Esto facilita el acceso del usuario a los datos se comienzan a familiarizar con los SI.
Grupos de Proyectos Funcionales
Esta estructura combina a analistas y programadores en grupos de proyectos empresariales. Se reconoce el objetivo de los SI dentro del negocio y se estructuran los SI en base a los mecanismos de demanda (Estrategia de SI) por sobre los mecanismos de oferta.
Para las operaciones todavía se sigue usando el enfoque tradicional.

Centro de Información y Apoyo de Decisiones
Las estructuras orientadas al apoyo para la toma de decisiones están ligadas a los centros de decisión. Los SI ahora también son responsables del manejo efectivo de los SI. Ambas estructuras tienen el objetivo de dar apoyo y fomentar el desarrollo de la computación controlada por el usuario y el management híbrido.

Estructuras Externas
Este enfoque se centra en el ambiente, en torno a líneas de servicio al consumidor para satisfacer la organización del negocio. Los grupos de SI alcanzan acuerdos de servicio con la comunidad de usuarios, quienes definen las obligaciones de los SI y las percepciones de valor del negocio.
Por otro lado, los SI son la empresa, y deben estar enfocados hacia el exterior. El entorno empresarial afectará a los SI y los SI influirán en la naturaleza del negocio. La estructura de los SI debe ser coherente con la estructura del negocio.
